Conference publications

Abstracts

XV conference

Nonlinear dynamics of binary polynucleotide chains

Yakushevich L.V., Krasnobaeva L.A.

Institute of Cell Biophysics of tre Russian Academy of Sciences, Russian, 142290, Pushchino, Institutskay str.3 Tomsk State University, Russian, Physical faculty, departmentof theoretical physics, Russian, 634050, Tomsk, pr. Lenina 36

Работа посвящена исследованию особенностей динамики нелинейных конформационных возмущений (кинков), активированных в бинарных полинуклеотидных цепочках. Такие цепочки встречаются как in vivo [1], так и могут быть синтезированы искусственно.

Разработан метод, с помощью которого в коэффициенты базового динамического уравнения – уравнения синус-Гордона [2], вводится линейная зависимость от концентраций оснований, и рассчитываются основные динамические характеристики кинка: его размер, энергия, плотность энергии и скорость распространения в бинарных полинуклеотидных цепочках.

Литература.

1. Yagil G. Genomics. т. 87. стр. 591-597, 2006.

2. Englander S.W., Kallenbach N.R., Heeger A.J., Krumhansl J.A., Litwin A. Proc. Natl. Acad. Sci. V. 77. P. 7222-7226. 1980.

• view as PDF