|
Conference publicationsAbstractsXV conferenceПрямое компьютерное моделирование влияния pH среды и редокс-состояния пластоцианина и цитохрома f на константу их связыванияМосковский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Биологический ф-т, каф. Биофизики, Россия, 119992, Москва, Ленинские горы, МГУ, Тел. (095)9390289, e-mail: abaturova@list.ru 1Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Физический ф-т, Россия, 119992, Москва, Ленинские горы, МГУ Транспорт электрона подвижным белком-переносчиком пластоцианином (Pc) в люмене тилакоида от цитохрома f цитохромного b6f комплекса к фотосистеме 1 является одной из ключевых стадий электрон-транспортной цепи фотосинтеза. Pc высших растений является небольшим (10 кДа) отрицательно заряженным белком, в качестве редокс центра несет атом меди. Цитохром f является субъединицей цитохромного b6f комплекса, в качестве редокс центра несет гем. Внемембранная часть цитохрома f (cytf) отрицательно заряжена, но в области связывания Pc имеет положительный заряд. Известно, что в образовании комплекса между Pc и cytf основную роль играют электростатические взаимодействия. Ранее [1] нами была разработана модель прямого компьютерного моделирования образования комплекса между двумя белками. Были оценены значения параметров модели для образования комплекса между окисленным Pc и восстановленным cytf при pH раствора 7. В данной работе мы изучаем влияние изменения редокс-состояния Pc и cytf на константу их связывания. Моделирование показало, что при pH раствора 7 и ионной силе 100 мМ константа связывания восстановленного Pc и окисленного cytf примерно в 1.5 раза выше, чем для окисленного Pc и восстановленного cytf. При изменении pH раствора (4-10 единиц) и ионной силы (50-300 мМ) константа связывания восстановленного Pc и окисленного cytf выше или равна константе связывания окисленного Pc и восстановленного cytf. Данный результат связан с тем, что у окисленного cytf вокруг области связывания Pc расположен более высокий положительный электостатический потенциал, чем у восстановленного cytf. А вокруг восстановленного Pc более высокий отрицательный потенциал, чем вокруг окисленного Pc. Данный результат показывает, что при моделировании транспорта электрона Pc от цитохромного b6f комплекса к фотосистеме 1 необходимо учитывать изменение электростатического потенциала вокруг Pc и cytf при изменении их редокс-состояния. |