Архив публикаций

Тезисы

XIII-ая конференция

Разнообразие нелинейных волновых решений

Якушевич Л.В., Краснобаева Л.А.¹, Шаповалов А.В.¹, Кинтеро Н.Р.²

Институт биофизики клетки РАН, Россия, 142290, г. Пущино, Институтская ул. 3,Тел.(0967)73-49-63, факс: (0967)330509; e-mail: yakushev@icb.psn.ru

¹1Томский Государственный Университет, Физический ф-т, каф. Теоретической физики, Россия, 634050, г. Томск, пр. Ленина 36, Тел.(3822)52-98-43, e-mail: larisa@phys.tsu.ru

²2Departamento de Fisica Aplicada I, E.U.P., Universidad de Sevilla, Virgen de Africa 7, 41001, Sevilla, Spain, e-mail: niurka@euler.us

1  стр.

В данной работе представлены все виды двухсолитонных решений нелинейного дифференциального уравнения, имитирующего вращательные колебания оснований ДНК. Как показано в [1], это уравнение имеет вид обыкновенного уравнения синус- Гордона с коэффициентами, зависящими от параметров ДНК.

Аналитические выражения для решений: кинк-кинк, кинк-антикинк, антикинк-антикинк и бризер получены в терминах ДНК. Данные решения содержат такие характеристики ДНК как момент инерции оснований (I), энергию (V), необходимую для того, чтобы повернуть основание на 90º, т.е. фактически разорвать водородные связи внутри пар оснований; константу (K’), характеризующую жесткость сахаро-фосфатной цепочки, расстояние (a) между ближайшими основаниями в ДНК, скорость солитона в ДНК (v).

В работе представлены трехмерные графики, иллюстрирующие поведение двухсолитонных решений во времени, рассчитаны величины энергий активации для каждого вида солитонов, сделаны оценки размеров двухсолитонных возмущений в двойных полинуклеотидных цепочках, состоящих только из A-T или только из G-C пар оснований.

Литература.

1. Якушевич Л.В., Краснобаева Л.А., Кинтеро Н.Р. “L-Aпара для ДНК”. В сб. Математика. Компьютер. Образование. Т. 11, стр. 807-810, 2004.