|
Conference publicationsAbstractsXVI conferenceЭлектростатические свойства промоторов Т7 ДНК, взаимодействующих с РНК-полимеразой E.coli.Институт биофизики клетки РАН, Россия, 142290, Пущино, Московской обл., Институтская ул., д.3, +7 (4967) 739319, dzhelyadin@gmail.com 11The University of Edinburgh, UK, EH9 3JR, Edinburgh, Kings Buildings, lptolik@gmail.com. Вычислен профиль распределения электростатического потенциала полного генома бактериофага Т7. Проведен сравнительный анализ электростатической и генетической карт Т7 генома. На электростатической карте Т7 ДНК определена локализация 3-х сильных и 5-ти минорных промоторов, взаимодействующих с хозяйской РНК-полимеразой E. coli (Еσ70). Этот фермент контролирует активность экспрессии ранней области Т7 ДНК, составляющей 20% фагового генома. Проведен сравнительный анализ электростатических свойств всех σ70-специфичных промоторов Т7 ДНК. В дальней upstream области 3-х главных промоторов, идентифицированы специфические электростатические элементы, различающиеся у разных промоторов. Найдена корреляция между электростатическими характеристиками промоторов и их функциональной активностью. Различие специфических электростатических элементов, выявленных у главных промоторов, определяет разный характер взаимодействия этих промоторов с РНК-полимеразой, объясняя тем самым высокий уровень экспрессии контролируемого ими оперона в разных условиях. |
