|
Архив публикацийТезисыXVI-ая конференцияМоделирование механизмов реакций ферментативного катализаХимический факультет Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова, Россия, 119991, Москва, Ленинские горы 1/3; 1 стр. (принято к публикации)В сообщении рассматриваются результаты моделирования механизмов реакций ферментативного катализа с использованием комбинированного метода квантовой механики – молекулярной механики (КМ/ММ). В этом подходе энергии и силы в активном центре молекулярной системы вычисляются по уравнениям квантовой химии, а роль белковой матрицы учитывается с помощью эмпирических силовых полей. Компьютерная реализация алгоритмов основана на использовании пакетов программ PCGAMESS и TINKER. Основное внимание уделено реакциям гидролиза субстратов сериновыми гидралазами, а также реакциям гидролиза гуанозинтрифосфата и аденозинтрифосфата. |
