Русский
!

Conference publications

Abstracts

XVI conference

Analysis of Ligand Binding to the Biochips

Nechipurenko Yu.D.

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Россия, 119991 Москва, ул. Вавилова, 32, +7 499 1351092

1 pp. (accepted)

В настоящее время биочипы широко применяются для анализа паттернов экспрессии генов в разных клетках. Анализ больших баз данных по связыванию нуклеиновых кислот на биочипах проводится в рамках теории адсорбции. Широко применяются изотермы Ленгмюра и Сипса. Для анализа изотерм адсорбции на биочипах наряду с указанными уравнениями и подходами Скетчарда и Хилла может быть применен метод «энергетических изотерм связывания». В рамках такого подхода рассчитывается зависимость связывания от энергии дуплексов, которые могут образовать «пробы», расположенные на подложке биочипа и участки «мишени» - молекул нуклеиновых кислот, которые находятся в исследуемом растворе. Данный подход позволяет представить экспериментальные данные по связыванию нуклеиновых кислот на чипах в виде характерной S-образной кривой. Поведение этой кривой при изменении концентрации мишени в растворе позволяет оценить концентрацию мишени и, таким образом, восстановить паттерны экспрессии в разных клетках.



© 2004 Designed by Lyceum of Informational Technologies №1533