|
Conference publicationsAbstractsXXII conferenceПрограммный комплекс pyPhotoSyn для определения состояния фотосинтетического аппарата по кинетике индукции флуоресценции хлорофиллаМосковский государственный университет имени М.В.Ломоносова, Биологический факультет, кафедра биофизики, РФ, 119991, Москва, Ленинские Горы 12, styx@biophys.msu.ru 1 pp. (accepted)Одним из основных биофизических методов, позволяющих оценивать эффективность первичных реакций фотосинтеза, является измерение кинетики индукции флуоресценции хлорофилла in vivo. В экологическом мониторинге используется целый ряд как исследовательских, так и коммерчески доступных приборов для измерения кинетики индукции флуоресценции хлорофилла. Нами разработан программный пакет pyPhotoSyn, представляющий исследователю удобную среду для оценки различных параметров фотосинтетического аппарата по данным, получаемых с помощью различных приборов. Пакет написан на языке программирования Python, имеет графический интерфейс и позволяет обрабатывать экспериментальные данные, получаемые с помощью приборов M-PEA (Hansatech Instruments, Великобритания), FluorPen (Photon Systems Instruments, Чешская Республика), МЕГА (кафедра биофизики Биологического факультета МГУ имени М.В.Ломоносова, Российская Федерация), а также позволяет импортировать данные из текстовых файлов и электронных таблиц. Модульная архитектура пакета позволяет легко добавлять различные методы обработки исходных данных. В настоящее время в состав пакета входят следующие модули: • JIP-тест по методике Рето Штрассера. Данный метод позволяет охарактеризовать скорость электрон-транспортных процессов в акцепторной части фотосистемы II по значениям интенсивности флуоресценции хлорофилла, измеренным на фиксированных временах от начала освещения объекта [1]; • уточнённый метод определения базового уровня флуоресценции Fo и нормированной начальной скорости нарастания интенсивности флуоресценции Mo по линейной аппроксимации начального участка индукционной кривой; • определение параметров реакций переноса электрона в реакционном центре (РЦ) фотосистемы II и обменных реакций между РЦ и пулом пластохинонов по трёхэкспоненциальному представлению кинетики индукции флуоресценции [2]; • определение вклада и характерного времени отдельных стадий переноса электрона по мультиэкспоненциальному разложению [3]. Работа выполнена при поддержке гранта РФФИ № 14-04-00326-а. Литература. 1. Strasser R.J., Tsimilli-Michael M., Srivastava A. Analysis of the Chlorophyll a Fluorescence Transient / In: Papageorgiou G.C., Govindjee (eds) Chlorophyll a fluorescence: a signature of photosynthesis. Advances in Photosynthesis and Respiration. Volume 19. Springer, Dordrecht, 2004, pp. 321-362 2. Плюснина Т.Ю., Воронова Е.Н., Гольцев В.Н., Погосян С.И., Яковлева О.В., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Редуцированная модель фотосистемы II для оценки характеристик фотосинтетического аппарата по данным индукции флуоресценции // Компьютерные исследования и моделирование, 2012, 4(4), с. 943–958. 3. Хрущев С.С., Плюснина Т.Ю. Анализ индукции флуоресценции хлорофилла с помощью мультиэкспоненциального разложения // Тезисы XXII Международной научной конференции «Математика. Компьютер. Образование», 26–31 января 2015 г., Пущино – в наст. сборнике.
|
