Conference publications

Abstracts

XXII conference

Forced oscillation angle of nitrogenous bases in the gene encoding interferon alpha 17 (IFNA17)

Yakushevich L.V., Krasnobaeva L.A.¹

Институт биофизики клетки РАН,

¹ГБОУ ВПО Сибирский государственный медицинский университет,

²ГБОУ ВПО «Национальный исследовательский Томский государственный университет»

1 pp. (accepted)

Группа белков – интерферонов – играет важную роль в медицине, так как благодаря им клетки становятся невосприимчивыми по отношению к вирусам. В нашей работе исследуются вынужденные угловые колебания азотистых оснований в гене, кодирующем интерферон alpha 17 (IFNA17).

Для моделирования угловых колебаний оснований, использована система из двух связанных нелинейных дифференциальных уравнений в частных производных, учитывающих эффекты диссипации и действие внешних периодических полей:

F(t) = Acos(Ωt).

Методами теории колебаний [1] получены решения этих уравнений в линейном приближении. Построены дисперсионные кривые, определяющие зависимость частоты плоских волн (w) от волнового вектора (q). Для решения системы уравнений в общем (нелинейном) случае использовалось приближение среднего поля, метод концентраций [2] и энергетический метод [3]. Получены решения в виде кинков и рассчитаны динамические характеристики кинков: плотность энергии (ρ), полная энергия (Е), масса покоя (m0) и размер (d). С помощью энергетического метода найдены скорость кинка (υ), путь (S), пройденный кинком, и время жизни кинка (τ).

Литература.

1. Крауфорд Ф. Волны. Берклеевский курс физики. М.: Наука, 1984. 529 стр.

2. Yakushevich L.V., Krasnobaeva L.V. A new approach to studies of non-linear dynamics of kinks activated in inhomogeneous polynucleotide chains // International Journal of Nonlinear Mechanics Vol. 43, No 10, 2008. Pp. 1074–1081.

3. McLaughlin D.W., Scott A.C. Perturbation analysis of fluxon dynamics // Phys. Rev. A Vol. 18, 1978. Pp. 1652-1663.

• view as PDF (in Russian) (PDF)