Русский

Conference publications

Abstracts

XXVII conference

Тестирование влияния эффекта дальнодействия на E.Coli: эксперимент и моделирование

Степанов А.В., Димитриева А.И., Тетельбаум Д.И.1, Попов А.П., Юманов Д.С., Коваленко А.В.

ЧГСХА, Россия, 428003, г. Чебоксары, ул. К, Маркса, 29, for.antonstep@gmail.com

1ННГУ им. Н. И. Лобачевского, Россия, 603950, г. Нижний Новгород, пр. Гагарина, 23, tetelbaum@phys.unn.ru

1 pp. (accepted)

На основе данных экспериментов была создана модель, согласно которой ионное или световое воздействие на пластину кремния, содержащего дислокации и покрытого слоем естественного оксида приводит к возбуждению гиперзвуковых волн (частоты ~100 ГГц). Гиперзвуковые волны распространяются вглубь кремния на расстояние превышающее глубину затухания. В недавней работе [1] было показано, что аналогичный механизм действует и в водной среде.

В данной работе экспериментальным путем и путем молекулярно-динамического моделирования исследуется действие гиперзвука на бактерии. Эксперимент проводится на E.Coli. Суточная культура облучается гиперзвуком, а затем происходит сравнение с контрольной группой. Молекулярно-динамическое моделирование с помощью кода LAMMPS [2] с применением потенциала ReaxFF [3] проводится для случая распространения гиперзвуковой волны через клеточную мембрану, влияние гиперзвука на структуру и особенности работы клеточной мембраны. Кроме того, методом молекулярной динамики исследуется влияния гиперзвука на органеллы внутри бактерии.

Работа выполнена с использованием оборудования Центра коллективного пользования сверхвысокопроизводительными вычислительными ресурсами МГУ имени М.В. Ломоносова [4].

Литература

1. Tetel’baum, D.I., et al., Role of the Solid–Aqueous Medium Interface in Transferring Light-Induced Excitation of Silicon // Technical Physics 64, 9, 2019 pp. 1350-1356.

2. Plimpton S. Fast Parallel Algorithms for Short-Range Molecular Dynamics // Journal of Computational Physics 117, 1, 1995. pp. 1-19.

3. van Duin A.C.T., et al. ReaxFF:  A Reactive Force Field for Hydrocarbons // The Journal of Physical Chemistry A 105, 41, 2001. pp. 9396-9409.

4. Воеводин Вл.В., и др. Практика суперкомпьютера "Ломоносов" // Открытые системы 7, 2012. Стр. 36-39.



© 2004 Designed by Lyceum of Informational Technologies №1533