Conference publications

Contents : Authors

• Abaturova A.M., Riznichenko G.Yu. Diffusion domains of cytochrome С near respiratory complexes III and IV in the mitochondrial respirasome upon binding to complex III (2026) 1 pp. (accepted)
• Abaturova A.M., Riznichenko G.Yu. The influence of the IV respiratory complex on the kinetics of cytochrome C binding with the III respiratory complex dimer in the Brownian dynamics model (2025) 1 pp. (accepted)
• Абатурова А.М., Ризниченко Г.Ю. Направленность движения молекул цитохрома с вблизи III дыхательного комплекса при транспорте электронов в модели броуновской динамики (2024) 1 pp. (accepted)
• Абатурова А.М., Ризниченко Г.Ю. Влияние расстояния между мембранами кристы митохондрии на скорость образования предварительного комплекса цитохрома С и димера III дыхательного комплекса в модели броуновской динамики (2023) 1 pp. (accepted)
• Abaturova A.M., Riznichenko G.Yu. The role of electrostatic interactions and the initial position of the cytochrome c molecule in Brownian dynamics simulation of encounter complex formation with III respiratory complex in the mitochondrial crista (2022) 1 pp. (accepted)
• Абатурова А.М., Браже Н.А., Ризниченко Г.Ю., Коваленко И.Б. Роль расстояния между мембранами кристы митохондрии в движении цитохрома С к сайту связывания у III дыхательного комплекса (2021) 1 pp. (accepted)
• Васюченко Е.П., Федоров В.А., Абатурова А.М., Коваленко И.Б. Исследование конформационных перестроек гема цитохрома с и с1 в процессе образования комплекса методами молекулярного моделирования (2021) 1 pp. (accepted)
• Abaturova A.M., Brazhe N.A., Kovalenko I.B., Riznichenko G.Yu, Rubin A.B. Brownian dynamics Simulation of cytochrome c and III respiratory complex formation (2020) 1 pp. (accepted)
• Васюченко Е.П., Федоров В.А., Абатурова А.М., Устинин Д.М., Коваленко И.Б. Молекулярное моделирование цитохромного bc1 комплекса с цитохромом с (2019) 1 pp. (accepted)
• Абатурова А.М., Коваленко И.Б., Федоров В.А., Рубин А.Б. Brownian dynamics simulation of complex formation of animal and yeast proteins cytochrome c with cytochrome c1 (2019) 1 pp. (accepted)
• Abaturova A.M., Fedorov V.A., Kovalenko I.B. Significance of local surface electrostatic charges of proteins in Brownian dynamics model of Fd-FNR formation of encounter complexes (2018) 1 pp. (accepted)
• Fedorov V.A., Khruschev S.S., Kovalenko I.B., Riznichenko G.Yu., Rubin A.B. Electron-transfer protein-protein complex formation ferredoxin from Chlamydomonas Reinhardtii with Ferredoxin-NADP+ reductase from Zеa mаys and hydrogenase from Chlamydomonas reinhardtii (2018) 1 pp. (accepted)
• Абатурова А.М., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Роль электростатических взаимодействий в образовании предварительных комплексов белков пластоцианина и цитохрома f, барназы и барстара (2013) 1 pp. (accepted)
• Хрущев С.С., Абатурова А.М., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Критерии анализа белок-белковых взаимодействий в броуновской и молекулярной динамике (2013) 1 pp. (accepted)
• Абатурова А.М., Хрущёв С.С., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Изучение влияния конформации белков на скорость их связывания с помощью метода броуновской динамики (2012) 1 pp. (accepted)
• Хрущёв С.С., Абатурова А.М., Устинин Д.М., Громов П.А., Коваленко И.Б., Грачёв Е.А., Ризниченко Г.Ю. Програмное обеспечение ProKSim для моделирования взаимодействия белков с помощью метода многочастичной броуновской динамики (2012) 1 pp.
• Abaturova A.M., Alekseenko A.E., Barsegov V.A., Zhmurov A.A., Knyazeva O.S., Kovalenko I.B., Morozov I.I., Riznichenko G.Yu., Rubin A.B., Trifonov S.V., Ustinin D.M., Kholodov Ya.A., Khruschev S.S. Modular software framework for multiscale biomolecular modeling (2011) 1 pp. (accepted)
• Абатурова А.М., Громов П.А., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Моделирование взаимодействия комплекса фотосистемы 1 с белками пластоцианином и флаводоксином (2010) 1 pp. (accepted)
• Diakonova A.N., Kovalenko I.B., Abaturova A.M., Riznichenko G.Yu. Direct Computer Simulation of Ferredoxin and Ferredoxin:NADP-redustase Interaction (2010) 1 pp. (accepted)
• Diakonova A.N., Kovalenko I.B., Abaturova A.M., Riznichenko G.Yu. Computer Simulation of Ferredoxin and Ferredoxin-NADP+ reductase Complex Formation (2009) 1 pp. (accepted)
• Knyazeva O. S., Kovalenko I. B., Abaturova A. M., Riznichenko G. Yu., Grachev E. A., Rubin A. B. Simulation of Electrostatic Interactions of Plastocyanin with Thylakoid Membrane and Transmembrane Protein Complexes (2009) 9 pp. (accepted)
• Lukashenko A.T., Knyazeva O.S., Kovalenko I.B, Abaturova A.M., Grachev E.A. Modeling of hydrophobic interaction in biological systems (2009) 1 pp. (accepted)
• Абатурова А.М., Громов П.А., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Грачев Е.А. Прямое компьютерное моделирование влияния pH среды и редокс-состояния пластоцианина и цитохрома f на константу их связывания (2008) 1 pp.
• Abaturova A. M., Kovalenko I. B., Riznichenko G. Yu., Rubin A. B. Direct Multiparticle Computer Simulation of Ionic Strength Dependence of the Assosiation Rate Constant for Flavodoxin and Photosystem I (2008) 8 pp. (accepted)
• Diakonova A. N., Kovalenko I. B., Abaturova A. M., Riznichenko G. Yu. Direct Computer Simulation of Ferredoxin and Ferredoxin:NADP⁺-reductase Complex Formation (2008) 6 pp. (accepted)
• Diakonova A.N., Abaturova A.M., Kovalenko I.B., Riznichenko G.Yu., Gromov P.A., Grachev E.A. Role of protein charges in the interaction between ferredoxin and ferredoxin-NADP+ reductase. (2008) 1 pp.
• Абатурова А.М., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Громов П.А., Грачев Е.А. Interaction of plastocyanin and cytochrome f molecules in the thylakoid lumen - direct computer simulation (2007) 1 pp.
• Abaturova A.M., Kovalenko I.B., Riznichenko, G.Yu., Gromov P.A., Grachev E.A. Brownian dynamics simulation of interaction of many plastocyanin and cytochrome f molecules (2006) 1 pp.
• Kovalenko I. B., Abaturova A. M., Gromov P. A., Grachev E. A., Riznichenko G. Yu., Rubin A. B. Simulation of plastocyanin and cytochrome f proteins interaction in solution at various ionic strength and pH (2006) 10 pp.
• Kovalenko I. B., Abaturova A. M., Gromov P. A., Ustinin D. M., Grachev E. A., Riznichenko G. Yu., Rubin A. B. Direct simulation of interaction of the proteins plastocyanin and cytochrome f (2005) 12 pp.
• Kovalenko I.B., Abaturova A.M., Jalal Kamali M., Ustinin D.M., Riznichenko G.Yu., Grachev E.A., Rubin A.B. Direct simulation of interaction processes of plastocyanin with Photosystem I in a photosyntheic membrane (2004) 12 pp.

Search