Русский
!

Conference publications

Abstracts

XVIII conference

Modeling of electron transfer from the acceptor part of photosystem I to mobile carriers

Diakonova A.N., Kovalenko I.B., Riznichenko G.Yu.

Russia, Moscow, 119992, Leninskie Gory, Lomonosov Moscow State University, Biophysical department

1 pp. (accepted)

Небольшой железосерный белок ферредоксин (Фд) опосредует реакции электронного переноса в разнообразных метаболических реакциях. Помимо циклического и нециклического транспорта в электрон-транспортной цепи (ЭТЦ) фотосинтеза, Фд участвует в азотном и серном обмене и реакциях выделения водорода. В ЭТЦ основным партнером Фд является ферредоксин:НАДФ+-редуктаза (ФНР), переносящая электроны на НАДФ+ с образованием НАДФН. При этом, восстановленный фотосистемой I (ФСI) Фд может передавать электроны на другие белки, включая гидрогеназу, нитритредуктазу, глутаматсинтазу и т.д. Благодаря ключевой роли Фд в анаболических процессах, понимание механизмов его регуляции имеет важное значение для экологии и биотехнологии.

Нашей задачей является создание прямой многочастичной модели акцепторной части ФСI и переноса электронов на ФНР и гидрогеназу. Разработанный в нашей лаборатории метод позволяет моделировать случайное движение и электростатические взаимодействия сотен белков в объеме и компартментах клетки и исследовать кинетику их взаимодействия [1]. В модели молекулы белков представляют собой твердые тела, движущиеся под действием случайной силы и электростатической силы, создаваемой содержащимися в объеме заряженными молекулами (белками) и мембраной. На основании нашей модели мы способны определить ключевые для взаимодействия с другими белками аминокислотные остатки молекул и исследовать процессы переключения зависимых от Фд электронных потоков метаболизма, в том числе приводящего к образованию биоводорода потока на гидрогеназу.



© 2004 Designed by Lyceum of Informational Technologies №1533