English
!

Архив публикаций

Тезисы

XV-ая конференция

К моделям грамматик диалектов кодирования генов

Эйнгорин М.Я.

ННГУ им. Н.И.Лобачевского,603136,НижнийНовгород,а/я35, E-mail:skit@vmk.unn.ru.

2  стр.

В работах, на основе известных базовых биологических закономерностей, выявлены и построены, трехмерные конструкции: кодонограмма и аминограммы диалектов [1-3], более детально в [4,5]. На их базе были выявлены новые фундаментальные закономерности грамматик кодирования генов. Найдены структурные взаимосвязи нуклеотидов и их параметров в кодонограмме, аминокислот и их параметров в аминограмме. Построена таблица систематизации аминокислот. За счет избыточности, заложенный в аминограммах диалектов приводится возможный аппарат изменчивости. Вторичное кодирование кодонограммы, за счет избыточности аминограмм, выявило в ДНК, РНК и мРНК существование регулярных скрытых слоев кодирования (ССК) генов.

В докладе рассматривается систематизация известных на сегодня диалектов [5]. Если записать кодон в виде Х1Х2Х3, в котором Хi (i=1-3) соответствуют нуклеотидам T,A,C или G, через Аj, j=1,20 обозначить 20 аминокислот, а через Х1Х2(А1,А2,А3,А4) обозначить элементарную кодоновую группу (ЭКГ) [1-4] с соответствующими ей аминокислотами (покрытиями) вдоль направления Х3 аминограммы, то для всех известных на сегодня 17-ти диалектов можно записать все отличные покрытия для ЭКГ. И если в кодонограмме 16 или 24 ЭКГ, то обнаружено 23 различных ЭКГ с совпадающими для всех диалектов (S) и 25–23 с не совпадающими (N) покрытиями. Если S и N вписать в плоскость Х1Х2 кодонограммы (ЭКГ), то обнаружится удивительная симметрия, смотри Таблицу. Для всей таблицы число S и N равно 8. При этом, квадрат I3 для всех диалектов

II3ж X1↓ X1↓ X1↓ X1↓ еI3

X2→ N N S S ← G

X2→ N S S S ← C

X2→ N N S S ← A

X2→ N N N S ← T

IV3д T ↑ A ↑ C ↑ G ↑ гIII3

содержит только S ЭКГ, квадрат IV3 – только N, квадраты II3 и III3 – смешанные и содержат по 3N+1S и 3S+1N ЭКГ соответственно. На сегодня таблица – константа диалектов или закон систематизации диалектов.

Работа является демонстрацией математической строгости строения грамматик живой природы.

Литература.

1. Эйнгорин M.Я, (14-18 октября 2002), «Кодирование гена и генная инженерия», Первый международный конгресс «БИОТЕХНОЛОГИЯ – состояние и перспективы развития», Сборник тезисов докладов, С. 13 – 14, Москва.

2. Эйнгорин М.Я, (10-14 ноября 2003), «Кодирование гена и генная инженерия - 2», Второй международный конгресс, там же, что и [1], том I, С. 27–30, Москва.

3. Эйнгорин М.Я, (14–18 марта 2005), «Таблица систематизации аминокислот молекулярной биологии и аминограммы», Третий и четвертый международные конгрессы, там же, что и [1], том I, С. 12–14, Москва. (Таблица № 1 повторена http://www/rosbiotechworld.ru/app/dop.pdf ).

4. Эйнгорин М.Я, «Модель основ грамматики кодирования генов», Вестник Нижегородского университета им. Н.И. Лобачевского, Серия «Математическое моделирование и оптимальное управление», выпуск 1 (27) 2004, 269-288.

5. Эйнгорин М.Я, «К моделям диалектов грамматик кодирования генов», там же, что и [4], выпуск 1 (28) 2005, 232 - 242.



© 2004 Дизайн Лицея Информационных технологий №1533