|
Архив публикацийТезисыXXIII-ая конференцияЭлектростатические взаимодействия электронтранспортных белков в процессе диффузионного сближенияМосковский государственный университет имени М.В. Ломоносова, Биологический ф-т, кафедра биофизики, Россия, 119992, Москва, Ленинские горы 1, стр. 12 1 стр. (принято к публикации)Работа посвящена исследованию процесса образования короткоживущих белок-белковых электрон-транспортных комплексов. При формировании таких комплексов в результате диффузии происходит сближение белков с одновременной пространственной ориентацией за счет электростатических взаимодействий и последующее образование диффузионно-столкновительных комплексов, которые затем могут трансформироваться в финальный комплекс. Однако остается неясным, в какой степени электростатические взаимодействия влияют на скорость образования комплексов белков на различных этапах сближения молекул. В данной работе исследована роль электростатических взаимодействий белков пластоцианина и цитохрома f в процессе формирования ими комплекса методом броуновской динамики. Была исследована зависимость скорости диффузионного сближения реакционных центров двух белков от заданного расстояния между этими центрами при их сближении и проанализировано распределение взаимных ориентаций белков по энергии электростатического взаимодействия. Показано, что электростатические взаимодействия между молекулами белков пластоцианина и цитохрома f при их сближении способствуют занятию энергетически выгодной взаимной ориентации одного белка относительно другого при расстояниях между кофакторами менее 5 нм. Начиная с расстояния 3 нм электростатические взаимодействия приводят к достоверно регистрируемому увеличению скорости сближения кофакторов, при этом энергия электростатического взаимодействия между белками становится сравнимой с kT.
Работа поддержана грантами РФФИ № 15-07-08927, № 15-04-08681, № 14-04-00302. |