|
Архив публикацийТезисыXXVI-ая конференцияМоделирование процесса переноса заряда в молекуле ДНКБашкирский государственный университет 1 стр. (принято к публикации)В настоящее время известно много различных экспериментов по переносу заряда в ДНК, интерпретации которых посвящено большое число теоретических работ. В частности в работе [1] показано, что конформационные возмущения в виде бризеров, возбуждаемые в так называемой PB-модели ДНК, взаимодействуют с зарядами. При этом характерная длина смещения связанного состояния "бризер-заряд" составила в этой модели около 20 сайтов. Мы предлагаем рассмотреть динамику переноса заряда в Y-модели молекулы ДНК, отличающейся от PB-модели тем, что изменение конформации происходит не за счет поперечного смещения нуклеотидов, а за счет их вращения вокруг сахаро-фосфатного остова. Начальное конформационное возмущение задаётся в виде солитонной пары "кинк-антикинк", центр которой приходится примерно на 50-й сайт молекулы ДНК (см. рис. 1). Основная плотность заряда находилась в пределах этого возмущения. После превращения пары "кинк-антикинк" в движущийся бризер информация о плотности заряда теряет смысл. Как видно из рис. 1, расстояние, которое проходит солитон, несущий в себе заряд, до его превращения в бризер, растёт с уменьшением коэффициента взаимодействия между конформационным возмущением и плотностью заряда, и может достигать величины порядка 80 сайтов. |
