!	Если во время конференции Вы планируете проживать в общежитие Пущино (других вариантов проживания в Пущино практически не осталось), то для поселения необходимо заполнить анкету. Анкету нужно прислать на адрес оргкомитета mce@mce.su до 17 января.

Архив публикаций

Тезисы

XXVII-ая конференция

Моделирование межмолекулярного взаимодействия нуклеотидов ДНК, углеродной наноструктуры сенсора секвенатора и компонентов буферного раствора, в процессе одномолекулярного ДНК-секвенирования

Захаров А.А., Пластун И.Л.

Саратовский государственный технический университет имени Гагарина Ю. А. wolfserk@mail.ru inna_pls@mail.ru

1 стр. (принято к публикации)

Целью данной работы является анализ путем численного моделирования уровня взаимодействия нуклеотидов ДНК с элементами буферного раствора и c сенсором секвенатора (поверхность которого обогащена малеимидом) при одномолекулярном ДНК-секвенировании.

Молекулярное моделирование производилось при помощи программных комплексов Gaussian 09 и DFTB+, основанных на теории функционала плотности (DFT).

В процессе секвенирования можно установить последовательность нуклеотидов в молекуле ДНК при помощи различных методик, в частности исследуется процедура одномолекулярного секвенирования в реальном времени. Идея метода состоит в определении последовательности ДНК за счет наблюдения за работой единичной молекулы ДНК-полимеразы в реальном времени.

В данной методике нуклеотиды ДНК осаждаются на специальную подложку, покрытую алканом, обогащённым малеимидом.

В ходе работы были рассчитаны и проанализированы карты распределения заряда, спектры и структуры взаимодействующих элементов при секвенировании.

В результате анализа были сделаны рекомендации по подбору оптимальных условий для увеличения качества одномолекулярного секвенирования.

открыть в PDF формате (на русском языке) (PDF)