|
Архив публикацийПостроение Вороного-Делоне для моделирования белок-белковых комплексовРоссия, Москва Выявление аминокислот, играющих ключевую роль в образовании белок-белковых комплексов, необходимо для понимания природы этих комплексов. Мы решили задачу автоматического поиска контактирующих аминокислот в белок-белковых комплексах с помощью построения Вороного-Делоне. Был проведен расчет для 70 белок-белковых комплексов, и для оценки значимости каждого типа контакта была составлена матрица вероятности случайного его образования. Наибольшие отклонения от случайного распределения наблюдаются для контактов типа Leu-Val, Leu-Phe, Leu-Leu. Для белок-белковых комплексов одного типа (а именно антитело-антиген) наибольшие отклонения от случайного распределения наблюдаются для пар Leu-Phe, Phe-Ser. |
