Архив публикаций

Тезисы

XVII-ая конференция

Локальные неоднородности структурно-динамических свойств ДНК и подходы к физическому картированию генома

Нечипуренко Ю.Д., Нечипуренко Д.Ю.¹, Ильичева И.А., Головкин М.В., Панченко Л.А.², Полозов Р.В.³, Гроховский С.Л.

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Россия, 119991 Москва, ул. Вавилова, 32, +7 499 135 10 92, nech99@mail.ru

¹Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Физический факультет, Россия, 119899, Москва, Воробьевы Горы, ne4ipur@gmail.com

²Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Биологический факультет, Россия, 119899, Москва, Воробьевы Горы, larandr@mail.ru

³Институт теоретической и экспериментальной биофизики, Россия, 142290, Московская область, Пущино, polrob@mail.ru

1  стр. (принято к публикации)

Ранее нами был предложен и развит метод исследования ДНК, основанный на расщеплении сахарофосфатного остова ДНК под действием ультразвука. Мы определили относительные вероятности расщепления сахарофосфатных связей в каждом из 16 динуклеотидов. Увеличение экспериментальных данных до выборки в более чем 20 тысяч нуклеотидов позволило установить вероятности расщепления для всех 256 тетрануклеотидов. Эти вероятности существенно различаются, что свидетельствует о гетерогенности локальных структурно-динамических характеристик ДНК. На подобную гетерогенность указывают также данные о химическом расщеплении ДНК под действием разного рода агентов, а также фермента ДНКазы I. Наличие существенной гетерогенности структурно-динамических свойств участков ДНК может служить ключом к физическому картированию генома – то есть выявлению маркеров, позволяющих регуляторным белкам и факторам экспрессии узнавать участки генома. В роли таких маркеров могут выступать участки ДНК, имеющие аномальные структурно-динамические характеристики.

• открыть в PDF формате