English
!

Архив публикаций

Количественные методы анализа расщепления ДНК ультразвуком

Нечипуренко Ю. Д., Головкин М. В., Нечипуренко Д. Ю., Ильичева И. А., Панченко Л. А., Полозов Р. В., Гроховский С. Л.

"Математика. Компьютер. Образование". Cб. трудов XV международной конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Ризниченко Ижевск: Научно-издательский центр "Регулярная и хаотическая динамика", 2008. Том 3, 200 стр. Стр. 26-35. (принято к публикации)

Ключевым моментом при количественном анализе электрофоретических гелей высокого разрешения, содержащих большое количество полос, является учет позиционного эффекта – зависимости интенсивности полосы от её положения на геле. Оценки зависимости относительных частот разрывов межнуклеотидных связей от типа нуклеотидов, получаемые при анализе картин расщепления фрагментов молекул ДНК под влиянием ультразвука или действия химических факторов, производились при помощи двух методов: а) линейно скользящего среднего; б) описания функции позиционной зависимости как полинома третьей степени. Оценки относительных частот разрывов межнуклеотидных связей для разных нуклеотидов приводят к сходным результатам вне зависимости от выбора конкретного метода для учета позиционного эффекта



© 2004 Дизайн Лицея Информационных технологий №1533