Русский
!

Conference publications

Abstracts

XIX conference

Multiparticle modeling of proteins ferredoxin and hydrogenase

Diakonova A.N., Kovalenko I.B., Riznichenko G.Yu.

Lomonosov Moscow State University, Biological Faculty, Biophysics Department, Russia, Moscow, 119992, Leninskie Gory, MSU

1 pp. (accepted)

В электрон-транспортной цепи фотосинтеза белок ферредоксин (Фд) служит конечным акцептором электрона с фотосистемы I. Восстановленный Фд может передавать электрон на несколько белков: при линейном электронном транспорте он восстанавливает ферредоксин-НАДФ+-редуктазу (ФНР), при циклическом – цитохром b6f-комплекс. Более того, электроны Фд могут использоваться в метаболических реакциях фиксации серы и азота. В некоторых организмах в определенных условиях Фд передает электроны на гидрогеназу – белок, способный восстанавливать протоны до молекулярного водорода, экологически чистого источника энергии. Этот процесс строго регулируется, и в зеленых водорослях Chlamydomonas sp. протекает только в анаэробных условиях при голодании по сере. Целью нашей работы является создание модели взаимодействия Фд и гидрогеназы, учитывающей геометрию и электростатические свойства белков [1]. На модели исследуется зависимость константы скорости связывания белков от свойств среды: ионной силы и pH. Поскольку основным конкурентом гидрогеназы за ферредоксин является ФНР, мы также провели сравнение результатов модели с построенной ранее моделью взаимодействия ферредоксина и ФНР [2].

Работа поддержана грантами РФФИ 11-04-01019-а и 11-04-01268-а.



© 2004 Designed by Lyceum of Informational Technologies №1533