|
Архив публикацийТезисыXIX-ая конференцияМногочастичное моделирование взаимодействия белков ферредоксина и гидрогеназыМосковский государственный университет имени М.В. Ломоносова, Биологический ф-т, каф. Биофизики, Россия, 119992, Ленинские горы, МГУ 1 стр. (принято к публикации)В электрон-транспортной цепи фотосинтеза белок ферредоксин (Фд) служит конечным акцептором электрона с фотосистемы I. Восстановленный Фд может передавать электрон на несколько белков: при линейном электронном транспорте он восстанавливает ферредоксин-НАДФ+-редуктазу (ФНР), при циклическом – цитохром b6f-комплекс. Более того, электроны Фд могут использоваться в метаболических реакциях фиксации серы и азота. В некоторых организмах в определенных условиях Фд передает электроны на гидрогеназу – белок, способный восстанавливать протоны до молекулярного водорода, экологически чистого источника энергии. Этот процесс строго регулируется, и в зеленых водорослях Chlamydomonas sp. протекает только в анаэробных условиях при голодании по сере. Целью нашей работы является создание модели взаимодействия Фд и гидрогеназы, учитывающей геометрию и электростатические свойства белков [1]. На модели исследуется зависимость константы скорости связывания белков от свойств среды: ионной силы и pH. Поскольку основным конкурентом гидрогеназы за ферредоксин является ФНР, мы также провели сравнение результатов модели с построенной ранее моделью взаимодействия ферредоксина и ФНР [2]. Работа поддержана грантами РФФИ 11-04-01019-а и 11-04-01268-а. |
