Архив публикаций

Содержание : Авторский указатель

• Васюченко Е.П., Холина Е.Г., Гудимчук Н.Б., Коваленко И.Б. Сравнительный анализ методов молекулярного докинга для моделирования взаимодействия пептида белка FtsZ с белками SepF и FtsA (2026) 1  стр. (принято к публикации)
• Вольхин И.А., Федоров В.А., Гудимчук Н.Б., Коваленко И.Б. Механические свойства и конформационная подвижность филаментов белков AtubA/B2 и FtsZ в археях и бактериях: исследование методом молекулярной динамики (2026) 1  стр. (принято к публикации)
• Холина Е.Г., Федоров В.А., Гудимчук Н.Б., Коваленко И.Б. Анализ конформационной подвижности белков FtsA, SepF (2026) 1  стр. (принято к публикации)
• Вольхин И.А., Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б. Исследование взаимодействия между пластоцианином и фотосистемой 1 гороха с использованием молекулярного моделирования (2025) 1  стр. (принято к публикации)
• Коваленко И.Б. Молекулярное моделирование в биологии и медицине (2025) (принято к публикации)
• Коваленко И.Б., Орехов Ф.С., Боздаганян М.Е., Холина Е.Г., Федоров В.А., Гудимчук Н.Б. Компьютерное моделирование тубулинов микротрубочек (2025) 1  стр. (принято к публикации)
• Холина Е.Г., Коваленко И.Б., Страховская М.Г. Изучение процесса транслокации биоцидов через наружные мембраны грамотрицательных бактерий (2025) 1  стр. (принято к публикации)
• Васюченко Е.П., Коваленко И.Б., Холина Е.Г., Федоров В.А., Хрущев С.С., Страховская М.Г. Моделирование Броуновской динамики взаимодействия фотосенсибилизаторов с оболочкой коронавируса SARS-CoV-2 (2024) 1  стр. (принято к публикации)
• Вольхин И.А., Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б. Моделирование взаимодействия фотосистемы I с пластоцианином и цитохромом c6 методом броуновской динамики (2024) 1  стр. (принято к публикации)
• Шубина А.И., Холина Е.Г., Федоров В.А., Коваленко И.Б. Исследование влияния веществ, регулирующих динамику микротрубочек, на конформационную подвижность протофиламентов тубулина (2024) 1  стр. (принято к публикации)
• Федоров В.А., Холина Е.Г., Гудимчук Н.Б., Коваленко И.Б. Исследование влияния таксола на конформационную подвижность белка тубулина методами молекулярной динамики (2023) 1  стр. (принято к публикации)
• Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б. Роль гидрофобных взаимодействий в процессе формирования комплекса белков пластоцианина и цитохрома с6 с цитохромом f в цианобактериях и зеленых водорослях (2023) 1  стр. (принято к публикации)
• Холина Е.Г., Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Страховская М.Г., Рубин А.Б. Идентификация сайтов связывания катионных фотосенсибилизаторов на вирусной оболочке методом броуновской динамики (2023) 1  стр. (принято к публикации)
• Холина Е.Г., Орехов Ф.С., Коваленко И.Б., Боздаганян М.Е., Страховская М.Г. Изучение взаимодействия катионных антисептиков с шероховатой липополисахаридной мембраной Pseudomonas aeruginosa (2022) 1  стр. (принято к публикации)
• Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Изучение механизмов взаимодействия белков пластоцианина и цитохрома с6 с цитохромом f в цианобактериях и зеленых водорослях (2022) 1  стр. (принято к публикации)
• Абатурова А.М., Браже Н.А., Ризниченко Г.Ю., Коваленко И.Б. Роль расстояния между мембранами кристы митохондрии в движении цитохрома С к сайту связывания у III дыхательного комплекса (2021) 1  стр. (принято к публикации)
• Васюченко Е.П., Федоров В.А., Абатурова А.М., Коваленко И.Б. Исследование конформационных перестроек гема цитохрома с и с1 в процессе образования комплекса методами молекулярного моделирования (2021) 1  стр. (принято к публикации)
• Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю. Молекулярное моделирование образование комплексов белков цитохрома c6 c цитохромом f из цианобактерий Nostoc, Phormidium laminosum и зеленой водоросли Chlamydomonas (2021) 1  стр. (принято к публикации)
• Хрущев С.С., Федоров В.А., Коваленко И.Б. Молекулярная модель фотосистемы 1 высших растений (2021) 1  стр. (принято к публикации)
• Хрущев С.С., Федоров В.А., Устинин Д.М., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Модель стромальных и гранальных ламелл хлоропласта с реалистичной геометрией компартментов (2021) 1  стр. (принято к публикации)
• Абатурова А.М., Браже Н.А., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Модель броуновской динамики образования комплекса цитохрома с и III дыхательного комплекса (2020) 1  стр. (принято к публикации)
• Коваленко И.Б., Орехов Ф.С., Жмуров А.А., Федоров В.А., Холина Е.Г., Гудимчук Н.Б. Построение молекулярно-динамической модели взаимодействия комплекса Ndc80 с микротрубочкой (2020) 1  стр. (принято к публикации)
• Лопанская Ю.Н., Холина Е.Г., Федоров В.А., Коваленко И.Б., Гудимчук Н.Б. молекулярно-динамическая модель взаимодействия комплекса NDC80 с микротрубочкой (2020) 1  стр. (принято к публикации)
• Холина Е.Г., Орехов Ф.С., Коваленко И.Б., Боздаганян М.Е., Страховская М.Г. Взаимодействие катионных антисептиков с плазматической бактериальной мембраной (2020) 1  стр. (принято к публикации)
• Абатурова А.М., Коваленко И.Б., Федоров В.А., Рубин А.Б. Моделирование образования комплекса белков цитохрома с и цитохрома с1 из млекопитающих и дрожжей методом броуновской динамики (2019) 1  стр. (принято к публикации)
• Васюченко Е.П., Федоров В.А., Абатурова А.М., Устинин Д.М., Коваленко И.Б. Молекулярное моделирование цитохромного bc1 комплекса с цитохромом с (2019) 1  стр. (принято к публикации)
• Дьяконова А.Н., Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю. Моделирование взаимодействия ферредоксина и ферредоксин-НАДФ-редуктазы из разных фотосинтезирующих организмов (2019) 1  стр. (принято к публикации)
• Коваленко И.Б., Орехов Ф.С., Жмуров А.А., Федоров В.А., Холина Е.Г., Гудимчук Н.Б. Построение крупнозернистой модели белка тубулина на основе траекторий молекулярной динамики (2019) 1  стр. (принято к публикации)
• Лопанская Ю.Н., Холина Е.Г., Федоров В.А., Коваленко И.Б., Гудимчук Н.Б. анализ взаимодействия кинетохорного комплекса NDC80 и микротрубочки методом молекулярно-динамических расчетов (2019) 1  стр. (принято к публикации)
• Федоров В.А., Хрущев С.С., Устинин Д.М., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Образование электрон-транспортного белок-белкового комплекса пластоцианина и цитохрома f высших растений, зеленой водоросли и цианобактерий (2019) 1  стр. (принято к публикации)
• Холина Е.Г., Орехов Ф.С., Коваленко И.Б., Боздаганян М.Е., Страховская М.Г. Создание крупно-зернистых липополисахаридных мембран P. aeruginosa с различными антигенными цепями (2019) 1  стр. (принято к публикации)
• Абатурова А.М., Фёдоров В.А., Коваленко И.Б. Роль локальных электростатических зарядов на поверхности белков при моделировании образования предварительных комплексов методом броуновской динамики (2018) 1  стр. (принято к публикации)
• Древаль В.Д., Федоров В.А., Холина Е.Г., Коваленко И.Б., Гудимчук Н.Б. Исследование процессов сборки и разборки микротрубочки комбинированным методом броуновской и молекулярной динамики (2018) 1  стр. (принято к публикации)
• Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б. Образование электрон-транспортного белок-белкового комплекса пластоцианина и цитохрома f высших растений и цианобактерий (2018) 1  стр. (принято к публикации)
• Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Абатурова А.М., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Образование электрон-транспортного белок-белкового комплекса ферредоксина и ферредоксин-НАДФ+ редуктазы из Zеа mays и гидрогеназы из Chlamydomonas reinhardtii (2018) 1  стр. (принято к публикации)
• Холина Е.Г., Коваленко И.Б., Орехов Ф.С., Боздаганян М.Е., Страховская М.Г. Cоздание крупно-зернистой модели одиночной молекулы липополисахарида P.aeruginosa (2018) 1  стр. (принято к публикации)
• Гудимчук Н.Б., Орлова М.В., Федоров В.А., Коваленко И.Б. Исследование конформации ГТФ-тубулина и ее роли для полимеризации микротрубочки (2017) 1  стр. (принято к публикации)
• Коваленко И.Б., Хренова М.Г. Современные методы молекулярного моделирования (2017) (принято к публикации)
• Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б. Роль электростатических взаимодействий в формировани электрон-транспортного комплекса белков пластоцианина и цитохрома f цианобактерии P. laminosum (2017) 1  стр. (принято к публикации)
• Холина Е.Г., Коваленко И.Б., Орехов Ф.С., Боздаганян М.Е., Страховская М.Г. Создание крупно-зернистой модели наружной мембраны клеточной стенки P.aeruginosa (2017) 1  стр. (принято к публикации)
• Галочкина Т.В., Зленко Д.В., Коваленко И.Б., Нестеренко А.М. Моделирование конформационной подвижности О-антигена липополисахарида грам-отрицательных бактерий (2016) 1  стр. (принято к публикации)
• Коваленко И.Б., Федоров В.А., Хрущев С.С. Электростатические взаимодействия электронтранспортных белков в процессе диффузионного сближения (2016) 1  стр. (принято к публикации)
• Устинин Д.М., Коваленко И.Б., Хрущев С.С. Моделирование экспериментально наблюдаемых сигналов в многочастичной модели фотосинтетической мембраны (2016) 1  стр. (принято к публикации)
• Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б. Идентификация взаимного расположения пары белков пластоцианина и цитохрома f, соответствующего состоянию функционально активного комплекса (2016) 1  стр. (принято к публикации)
• Холина Е.Г., Нестеренко А.М., Зленко Д.В., Коваленко И.Б. Построение модели внешней мембраны клеточной стенки мутантной формы грам-отрицательной бактерии Salmonella (2016) 1  стр. (принято к публикации)
• Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б. Объединенный метод броуновской и молекулярной динамики для исследования белок-белковых взаимодействий (2015) 1  стр. (принято к публикации)
• Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б. Роль конформационных изменений в молекулах белков пластоцианина и цитохрома f в кинетике их связывания (2015) 1  стр. (принято к публикации)
• Холина Е.Г., Нестеренко А.М., Зленко Д.В., Коваленко И.Б. Построение модели молекулы октакатионного металлофталоцианина (2015) 1  стр. (принято к публикации)
• Галочкина Т.В., Нестеренко А.М., Коваленко И.Б., Зленко Д.В. Построение модели молекулы липополисахарида (2014) 1  стр. (принято к публикации)
• Дьяконова А.Н., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Моделирование зависимости скорости взаимодействия ферредоксина с ФНР и гидрогеназой от pH и ионной силы (2013) 1  стр. (принято к публикации)
• Зленко Д.В., Дьяконова А.Н., Хрущев С.С., Коваленко И.Б., Рубин А.Б. Исследование взаимодействия ферредоксина и ФНР методом молекулярной динамики (2013) 1  стр. (принято к публикации)
• Мамонов П.А., Коваленко И.Б., Хрущев С.С., Рубин А.Б. Усовершенствованный подход к описанию электронного транспорта при прямом многочастичном моделировании фотосинтетических мембран (2013) 1  стр. (принято к публикации)
• Устинин Д.М., Коваленко И.Б., Хрущев С.С. Распараллеливание алгоритмов многочастичной броуновской динамики для графических процессоров (2013) 1  стр. (принято к публикации)
• Хрущев С.С., Абатурова А.М., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Критерии анализа белок-белковых взаимодействий в броуновской и молекулярной динамике (2013) 1  стр. (принято к публикации)
• Абатурова А.М., Хрущёв С.С., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Изучение влияния конформации белков на скорость их связывания с помощью метода броуновской динамики (2012) 1  стр. (принято к публикации)
• Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю. Многочастичное моделирование взаимодействия белков ферредоксина и гидрогеназы (2012) 1  стр. (принято к публикации)
• Коваленко И.Б., Князева О.С., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Компьютерное моделирование взаимодействия белков в фотосинтетической мембране (2012) 1  стр. (принято к публикации)
• Хрущёв С.С., Абатурова А.М., Устинин Д.М., Громов П.А., Коваленко И.Б., Грачёв Е.А., Ризниченко Г.Ю. Програмное обеспечение ProKSim для моделирования взаимодействия белков с помощью метода многочастичной броуновской динамики (2012) 1  стр.
• Абатурова А.М., Алексеенко А.Е., Барсегов В.А., Жмуров А.А., Князева О.С., Коваленко И.Б., Морозов И.И., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б., Трифонов С.В., Устинин Д.М., Холодов Я.А., Хрущёв С.С. Модульная программная платформа для многоуровневого моделирования биомолекулярных систем (2011) 1  стр. (принято к публикации)
• Абатурова А.М., Громов П.А., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Рубин А.Б. Моделирование взаимодействия комплекса фотосистемы 1 с белками пластоцианином и флаводоксином (2010) 1  стр. (принято к публикации)
• Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Абатурова А.М., Ризниченко Г.Ю. Прямое компьютерное моделирование взаимодействия ферредоксина и ферредоксин:НАДФ-оксидоредуктазы (2010) 1  стр. (принято к публикации)
• Князева О.С., Коваленко И.Б., Грачев Е.А., Ризниченко Г.Ю. Моделирование диффузии пластоцианина и его взаимодействий с фотосинтетической мембраной и трансмембранными белковыми комплексами (2010) 1  стр. (принято к публикации)
• Дьяконова А.Н., Коваленко И.Б., Абатурова А.М., Ризниченко Г.Ю. Моделирование процесса образования комплекса ферредоксина и ферредоксин:НАДФ+-оксидоредуктазы (2009) 1  стр. (принято к публикации)
• Князева О. С., Коваленко И. Б., Абатурова А. М., Ризниченко Г. Ю., Грачев Е. А., Рубин А. Б. Модель электростатических взаимодействий пластоцианина с тилакоидной мембраной и встроенными в нее трансмембранными белковыми комплексами (2009) 9  стр. (принято к публикации)
• Лукашенко А.Т., Князева О.С., Коваленко И.Б., Абатурова А.М., Грачев Е.А. Моделирование гидрофобных взаимодейтсвий в биологических системах (2009) 1  стр. (принято к публикации)
• Абатурова А. М., Коваленко И. Б., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Прямое многочастичное компьютерное моделирование влияния ионной силы раствора на константу связывания флаводоксина и фотосистемы 1 (2008) 8  стр. (принято к публикации)
• Абатурова А.М., Громов П.А., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Грачев Е.А. Прямое компьютерное моделирование влияния pH среды и редокс-состояния пластоцианина и цитохрома f на константу их связывания (2008) 1  стр.
• Дьяконова А. Н., Коваленко И. Б., Абатурова А. М., Ризниченко Г. Ю. Прямое компьютерное моделирование образования комплекса ферредоксина и ферредоксин:НАДФ⁺ - оксидоредуктазы (2008) 6  стр. (принято к публикации)
• Дьяконова А.Н., Абатурова А.М., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Громов П.А., Грачев Е.А. Роль точечных зарядов во взаимодействии белков ферредоксина и ферредоксин-НАДФ+-оксидоредуктазы. (2008) 1  стр.
• Абатурова А.М., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Громов П.А., Грачев Е.А. Взаимодействие молекул пластоцианина и цитохрома f в люмене тилакоида - прямое компьютерное моделирование (2007) 1  стр.
• Абатурова А.М., Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю., Громов П.А., Грачев Е.А. Модель броуновской динамики взаимодействия многих молекул пластоцианина и цитохрома f (2006) 1  стр.
• Коваленко И. Б., Абатурова А. М., Громов П. А., Грачев Е. А., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Моделирование взаимодействия белков пластоцианина и цитохрома f в растворе в зависимости от ионной силы и pH среды (2006) 10  стр.
• Коваленко И. Б., Абатурова А. М., Громов П. А., Устинин Д. М., Грачев Е. А., Ризниченко Г. Ю., Рубин А. Б. Прямое моделирование процессов взаимодействия пластоцианина с цитохромом f в растворе (2005) 12  стр.
• Коваленко И.Б., Абатурова А.М., Камали Джалал М., Устинин Д.М., Ризниченко Г.Ю., Грачев Е.А., Рубин А.Б. Прямое моделирование процессов взаимодействия пластоцианина с фотосистемой 1 в фотосинтетической мембране (2004) 12  стр.
• Коваленко И.Б., Ризниченко Г.Ю. Моделирование циклического электронного транспорта вокруг фотосистемы I (2003) 12  стр.
• Коваленко И.Б., Устинин Д.М., Грачев Н.Е., Грачев Е.А., Ризниченко Г.Ю. Прямое моделирование циклического транспорта электронов вокруг фотосистемы I (2003) 10  стр.

Поиск